□公式予選2回目 天候：晴 | コース：ドライ | 気温21度 | 路面温度30度

　予選2回目は15時10分に開始。最初の15分間はGT300、つづく15分間はGT500クラスの、それぞれ全車が走行するセッションから始まった。サーキットの上には1回目と同じく青空が広がり、開始時点での気温は21度と、1回目が行われた午前中よりやや上がった。路面温度は30度だった。

　予選1回目に出走できなかったNo.111 KUMHO GREEN-TEC BOXSTER-GTはここで走行。第2ドライバーは滑川健から壺林貴也に交代したが、第1ドライバーの菊地靖ともども予選通過基準タイムをクリアし、決勝出走が可能になった。一方、1回目で基準タイムをクリアできなかったNo.67 triple aガイヤルドRG-3は予選不通過となり、決勝日朝のフリー走行のタイムを基準に決勝出走の可否が決定されることになった。

　ひきつづき、GT300クラスからスーパーラップ開始。最初に出走したNo.31 apr MR-S（峰尾恭輔）は自身の1回目のタイムを大きく上回り、その後のポール争いが激しくなることを予感させる。つづくNo.7 RE雨宮RX-7（井入宏之）はエンジン系のセンサーにトラブルを発生してアタックができなかったが、3番目に走ったNo.62 WILLCOM ADVAN VEMAC408R（柴原眞介）は1分42秒185と、予選1回目のトップタイムより0.3秒以上速いタイムをマーク。これがとりあえずのターゲットタイムとなる。その直後に走ったNo.101 TOY STORY Racing apr MR-S（大嶋和也）と、6番目出走のNo.33 HANKOOK NSC PORSCHE（木下みつひろ）は1分42秒309というまったく同タイムでNo.62の後ろに並び、1回目に上位だったNo.33が前、No.101が後ろということに。その後のNo.26 ユンケルパワータイサンポルシェ、No.43 ARTA GaraiyaはNo.62以下3台のタイムを上回れず、このままいけば柴原眞介の通算ポール獲得記録が更新なるかと思われた。しかし、最後に走ったNo.88アクティオムルシェRG-1（マルコ・アピチェラ）は、セクター2まではNo.62に若干遅れたものの、セクター3で遅れを取り戻し、1分42秒112というタイムでクラスポールを獲得してみせた。アピチェラのポールポジションは06年の第5戦SUGO以来。

　その後、5分間のインターバルをおいてGT500クラスのスーパーラップがスタート。No.12カルソニックインパルZ（ブノワ・トレルイエ）からコースに出ていくが、このタイムアタックが圧巻だった。今回から新車になり、セットアップが十分でないマシンを、ぎりぎりのところでコントロール。1分33秒949と、自身の1回目のタイムを0.5秒も上回ってみせる。その後の5台はいずれもこれを更新することができず、これでNo.12の3列目以内が確定。7番目に出走したNo.17 REAL NSX（金石年弘）がようやくこれを破り、暫定トップを奪取する。だが、つづくNo.1 宝山TOM'S SC430（アンドレ・ロッテラー）はさらにこれを更新。一方、予選1回目に2番手だったNo.8 ARTA NSX（伊藤大輔）は65kgのウエイトハンデがさすがに応えたか、No.1のタイムを上回れなかった。
　最後のアタッカーはNo.18 TAKATA童夢NSX（小暮卓史）。予選1回目には2番手以下を0.4秒以上引き離してみせた小暮がどんな走りを披露するのか。注目が集まる中、たたき出したタイムは1分33秒066。05年に立川祐路（ZENTセルモスープラ）がマークしたレコードタイムを0.04秒上回り、新たなレコードを樹立した。No.18のポールは、前戦・岡山で道上龍が獲得したのにつづき2戦連続。NSX勢としては開幕以来3戦連続となる。SC430勢ではNo.1 宝山TOM'S SC430が2番手で最上位。フェアレディZ勢はNo.12 カルソニックインパルZの5番手が最上位だった。